課題5以下のアミノ酸配列のタンパク質が膜タンパク質であるか否かを SOSUI により調べなさい。 また、実際の立体構造データが存在するものについては、PDB よりデータをダウンロードし、 立体構造データが存在しないものについては、SWISS-MODEL で構造予測して構造を確認しなさい。 これらの結果より、このタンパク質の機能および このタンパク質が膜タンパク質である場合は、膜にどのように埋もれているか考察しなさい (「膜タンパク質の特徴」の図中(a)〜(d)のどの形式であるかなど)。 Sequence 1 evklsgdarmgvmyngddwnfssrsrvlftmsgttdsglefgasfkahesvgaetgedgt vflsgafgkiemgdalgasealfgdlyevgytdlddrggndipyltgderltaednpvll ytysagafsvaasmsdgkvgetseddaqemavaaaytfgnytvglgyekidspdtalmad meqlelaaiakfgatnvkayyadgeldrdfaravfdltpvaaaatavdhkayglsvdstf gattvggyvqvldidtiddvtyyglgasydlgggasivggiadndlpnsdmvadlgvkfkf Sequence 2 mapmlsgllarlvklllgrhgsalhwraagaatvllvivllagsylavlaergapgaqli typralwwsvetattvgygdlypvtlwgrcvavvvmvagitsfglvtaalatwfvgreqe rrgh Sequence 3 MVQKSRNGGVYPGTSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSVLSKPRTG GAGAGKPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEK SSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASI AVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGF LCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLI GVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTW |