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７．創薬とバイオインフォマティクス

７-３．受容体に基づく設計

■　Receptor-Based Drug Designの手順（F1.2）

  • 立体構造データの収集
  • 活性部位の特定
  • 活性部位とリガンドの相互作用の解析
  • デザイン

■　リガンドとレセプターとの相互作用の基礎（F1.3）

  • 活性部位の形状
  • 受容体と基質の相互作用の解析
    • 静電相互作用
    • 水素結合
    • 疎水性相互作用
  • 水の役割（F1.6）

■　受容体の改変と活性（F2.1.3-F2.1.7）

リン酸化酵素活性（nM）
p38(PDB ID: 1a9u)100
EKR2(PDB ID: 1pme)不活性
p38変異体[T106M]不活性
EKR2変異体[Q105T]13

[ 演習 ]
立体構造を確認し、阻害剤の結合の様子がよく見える角度でスクリーンショットを撮る。 2つのタンパク質の向きをそろえること。

■　デザインの例（F2.1.10-F2.1.11）

↓

■　サクセス・ストーリー（F2.9）

  • HIV-1プロテアーゼ


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